Erdészettudományi Közlemények / 1. évfolyam / 1. szám / 83-93. oldal
előző | következő

Dunántúli Leuce nyár populációk genetikai vizsgálata RAPD és cpDNS markerekkel

Benke Attila, Cseke Klára és Borovics Attila

Kapcsolat a szerzőkkel

Levelező szerző: Benke Attila

Cím: H-9600 Sárvár, Várkerület 30/A.

e-mail cím: benke[at]ertisarvar.hu

Kivonat

A kutatás a fehér nyár és a rezgő nyár fontosabb dunántúli populációinak populációgenetikai vizsgálatát célozta. A cél e populációk genetikai változatosságának felmérése, valamint a teljes molekuláris genetikai változatosság megoszlásának vizsgálata volt. A populációgenetikai vizsgálatokban RAPD és cpDNS markerek alkalmazására került sor. A RAPD vizsgálatokba a teljes gyűjtési területet lefedő mintasorból 267, a PCR-RFLP vizsgálatba 300 egyedet vontunk be. Két, nagyfokú polimorfizmust mutató RAPD primerrel végzett vizsgálatok során a belső-somogyi állományok mutatták mindkét alapfaj esetében a legmagasabb diverzitás értékeket, a Nei-féle genetikai távolság alapján szerkesztett dendrogram ugyanakkor nem mutatott szoros kapcsolatot az egyes populációk genetikai és földrajzi távolsága között. A 4 cpDNS primerpárral végzett PCR-RFLP vizsgálat alkalmával a legmagasabb diverzitás értékeket a fehér nyárnál a kis-balatoni, a rezgő nyár populációk közül pedig a villányi populáció mutatta. A Nei-féle genetikai távolságok a cpDNS markerek esetében sem mutattak szoros kapcsolatot a populációk földrajzi távolságával. A molekuláris genetikai változatosság mindkét markerezési eljárás tekintetében a populációkon belüli varianciából ered.

Kulcsszavak: Leuce nyárak, molekuláris genetikai változatosság, Shannon-index, RAPD, cpDNS, Nei-féle genetikai távolság

  • Allaby, M. 2004: “Shannon-Wiener index of diversity.” a Dictionary of Ecology. 2004. Encyclopedia.com. (April 12, 2010). Egyéb URL
  • Bartha D. és Bordács S. 1990: Elektrophoretische Untersuchungen an Weißpappel-Populationen in Ungarn. Die Holzzucht, 44: 23–25.
  • Bartha D. 1991: Gibt es Bodenrassen bei der Weisspappel? Allgemeine Forst Zeischrift 46: 877.
  • Bartha D. 1999: Phänologische und taxonomische Untersuchungen bei den einheimschen Populationen der Weisspappel (Populus alba L.). Publ. Univ. Horti. Industriaeque Alimentariae 59: 85–93.
  • Bartha D. 2005: Ist die Graupappel eine eigene Art? Taxonomische Untersuchungen an den Populationen der Weisspappel (Populus alba L.). Allgemeine Forst Zeitschrift/Der Wald 60: 252–254.
  • Bisztray Gy. 2001: Molekuláris genetikai markerek. 424. In: Velich I. (ed.): Növénygenetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
  • Bordács S. 2002: A DNS-polimorfizmus elemzéséhez alkalmazott módszerek. 53. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
  • Grivet D.; Heinze B.; Vendramin GG. and Petit RJ. 2001: Genome walking with consensus primers: application to the large single copy region of chloroplast DNA. Molecular Ecology Notes 1: 345–349. DOI: 10.1046/j.1471-8278.2001.00107.x
  • Hajósné Novák M. 1999: A PCR-technikán alapuló módszerek. 44–48. In: Hajósné Novák M. (ed.): Genetikai variabilitás a növénynemesítésben. Mezőgazda Kiadó, Budapest
  • Heinze, B. 2007: A database of PCR primers for the chloroplast genomes of higher plants. Plant Methods, 3: 4. DOI: 10.1186/1746-4811-3-4
  • Koltay Gy. és Kopecky F. 1954: Őshonos nyáraink leromlott öröklöttségének megjavítása. Erdészeti Kutatások 2: 65–86.
  • Lexer, C.; Fay, M.F.; Joseph, A.; Nica, M.S. and Heinze, B. 2005: Barrier to gene flow between two ecologically divergent Populus species, P. alba (White poplar) and P. tremula (European aspen): the role of ecology and life history in gene introgression. Molecular Ecology 14: 1045–1057. DOI: 10.1111/j.1365-294x.2005.02469.x
  • Lexer, C.; Buerkle, C.A.; Joseph, J.A.; Heinze, B. and Fay, M.F. 2007: Admixture in European Populus hybrid zones makes feasible the mapping of loci that contribute the reproductive isolation and trait differences. Heredity 98: 74–84. DOI: 10.1038/sj.hdy.6800898
  • Lexer, C.; Joseph, J.; Loo, M. Van, Barbará, T.; Heinze, B.; Bartha D.; Castiglione, S.; Fay, M. and Buerkle, C. A. 2010: Genomic Admixture Analysis in European Populus spp. Reveals Unexpected Patterns of Reproductive Isolation and Mating. Genetics 186: 699–712. DOI: 10.1534/genetics.110.118828
  • Mátyás Cs. 2002a: A génszintű változatosság és elemzése. 15. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
  • Mátyás Cs. 2002b: Az allélváltozatosság statisztikai elemzése. 35–40. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
  • Peakall, R. and Smouse, P.E. 2006: GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes 6: 288–295. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
  • Podani J. 1997: Bevezetés a többváltozós biológiai adatfeltárás rejtelmeibe. Scientia Kiadó. Budapest p.145.
  • Sabatti, M.; D’Ovidio, R.; Tanzarella, O.A. és Scarascia Mugnozza, G.E. 2001: Assessment of geographic variation by RAPD markers among Italian open-pollinated progenies of Populus alba L. Genetic Resources and Crop Evolution 48(5): 423–428. DOI: 10.1023/A:1012095401517
  • Sánchez, N.; Grau, J. M.; Alba, N.; Manzanera, J. A. and de los Angeles Bruno, M. 2000: Genetic Characterisation of Populus tremula Regions of Origin is Spain Using RAPD Fingerprints. Silvae Genetica 49(2): 66–71.
  • StatSoft, Inc. 2001. STATISTICA for Windows [Computer program manual]. Tulsa, OK: StatSoft, Inc., 2300 East 14th Street, Tulsa, OK 74104, phone: (918) 749-1119, fax: (918) 749;2217, email: info@statsoft.com, Egyéb URL
  • Open Acces - Nyílt hozzáférés

    A cikk teljes terjedelmében szabadon letölthető, és megfelelő forrásmegjelöléssel szabadon felhasználható.

    Javasolt hivatkozás:

    Benke A., Cseke K. és Borovics A. (2011): Dunántúli Leuce nyár populációk genetikai vizsgálata RAPD és cpDNS markerekkel. Erdészettudományi Közlemények, 1(1): 83-93.

    1. évfolyam 1. szám,
    83-93. oldal

    Közlésre elfogadva:
    2011. szeptember 1.

    Kapcsolódó cikkek
    a folyóiratban

    7

    A szerzők további cikkei a folyóiratban

    1

    Témájukban kapcsolódó cikkek az Erdészettudományi Közleményekben*

    A szerzők további megjelent cikkei az Erdészettudományi Közleményekben

    * Automatikusan generált javaslatok a szerzők által megadott kulcsszavak más cikkek címében és kivonataiban való előfordulása alapján. Részletesebb kereséshez kérjük használja a manuális keresést.